中超联赛第二阶段赛事的组织流程与第一阶段基本一致。然而，有一个细节值得留意，那就是赛事组委会在第二阶段继续对部分裁判员实施区域间的轮换，目的在于保障赛事公正性的双重保障。例如，原本在首回合比赛中执法的两支球队，其裁判员原则上不得在次回合比赛中担任主裁判。裁判员的选拔需严格遵守地域回避原则。与此同时，随着新赛季中甲联赛的同期开启和中乙联赛7月2日的开赛，各级别联赛对裁判员的需求激增。然而，受疫情影响，一些裁判员（兼职）由于无法请假而无法赴赛区执法，这些因素客观上增加了裁判员选拔工作的难度。
据消息，国际级裁判傅明已回归国内，预计他将在首阶段中超结束前重返执法岗位。
中超第二阶段分赛区情况如下：
梅州赛区：梅州客家、北京国安、广州城、河南嵩山龙门、武汉长江、武汉三镇
海口赛区：山东泰山、长春亚泰、河北队、上海申花、天津津门虎、成都蓉城
大连赛区：上海海港、广州队、深圳队、沧州雄狮、大连人、浙江队
